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As bactérias podem ser classificada em relação a respiração tanto como aeróbicas quanto anaeróbicas, ou seja, sobrevivem tanto na presença de (oxigênio) com na sua ausência, dependendo do tipo de bactéria. Quanto a sua nutrição, elas podem ser consideradas autótrofas ou heterótrofas, isto é, bactérias autótrofas são capazes de produzir seu próprio alimento - bactérias fotossintetizantes - e as bactérias heterótrofas não conseguem produzir seu próprio alimento, por isso necessitando então alimenta-se de outras fontes de matérias orgânicas.
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