Question

por que a divisão regional do Brasil feita pelo IBGE respeita os limites dos estados

Answer 1

Porque a divisão geoeconômica proposta por Pedro Geiger, leva em conta os aspectos naturais e humanos. Essa divisão consiste de três regiões e suas fronteiras não coincidem com as fronteiras estaduais: Amazônia, Centro-Sul e Nordeste. 

A divisão feita pelo IBGE levou em consideração apenas aspectos naturais na divisão do país, como clima, relevo, vegetação e hidrografia; por essa razão, as regiões também são conhecidas como "regiões naturais do Brasil".