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É uma teoria que diz o seguinte: células procariontes primitivas teriam fagocitado a mitocondria e o cloroplasto, tendo em vista que ambos possuem DNA própria, entretanto a célula em vez que digerir a mitocondria, acabou estabelecendo uma relação mutalistica com a mesma, beneficiando os dois. Está é uma das teorias que explicam o surgimento de autótrofos e eucarionte.
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A teoria endossimbiótica admite que cloroplastos e mitocôndrias tiveram sua origem a partir de um procarionte que viveu em simbiose com uma célula eucarionte.
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