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A diferença básica é que uma é o inverso do processo da outra. Ou seja, na fotossíntese forma-se glicose e oxigênio como produtos finais, a partir de gás carbônico e água. Na respiração aetóxica, forma-se gás carbônico e água, a partir da quebra da molécula de glicose e a combustão desta pelo oxigênio.
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