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Consiste no DNA que herdamos da parte materna, que possui uma carga genética própria, sendo diferente do DNA nuclear. No entanto não possui diferença na sua composição química em relação ao DNA nuclear mas possui um código genético apenas seu. Contém um genoma haploide por ser apenas de origem materna não havendo recombinação pois se acredita que as mitocôndrias dos espermatozoides são destruídas pelo grande para feminino após a fecundação.
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