Question

A pontuação muda a entonação eo sentido da frase?

Answer 1

Sim.

Por exemplo:''Não irei à festa hoje''.
                     ''Não, irei à festa hoje''.

Ambas possuem sentidos e entonação diferentes. Na primeira, o sujeito não irá à festa e não há pausas da vírgula. Na segunda, o sujeito irá à festa e há uma pausa no início. 

Answer 2

Sim. É muito importante, até quando falamos devemos usar a entonação para que possamos ser compreendidos.
Deve ser usar corretamente a pontuação para que não gere mal entendidos como por exemplo: "Não vou ao shopping." entende-se que a pessoa não vai sair, e "Não, vou ao shopping" já dá pra entender que ela vai.
Então é muito importante usar pontuação e a entonação