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Por estar no meio do Atlântico, o arquipélago é ponto de passagem e encontro de várias espécies oceânicas, como tubarões, atuns, marlins e cavalas. Além desses ilustres visitantes, o arquipélago possui também uma fauna subaquática própria que, se por um lado se assemelha com a fauna de Fernando Noronha, por outro contém alguns elementos distintos muito interessantes, como a presença da floresta de Caulerpa (um tipo de alga) e os morfotipos exóticos do peixe-anjo (Holacanthus ciliaris), resultado de diversos cruzamentos dentro da mesma população da espécie.
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