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Os inseticidas possuem moléculas químicas que atuam numa região específica do inseto, como afetando seu sistema nervoso, seu sistema digestivo, impedindo-o de completar seu ciclo de vida e deixar novos descendentes. Já o controle biológico usa o inimigo natural do inseto considerado praga para realizar o controle de forma natural, podendo ser predadores (como a joaninha faz com o pulgão) e parasitóides (como algumas microvespas fazem com lagartas). Entretanto, é possível uma associação de inseticidas com controle biológico, já que numa lavoura nem sempre há uma única praga, buscando sempre o equilíbrio.
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