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Existe 2 tipos de tratamentos com CT (células-tronco) atualmente, que é a CTH (CTHeterólogo) e CTA (CTAutólogo). Contudo são tratamentos novos e ainda estão em desenvolvimento.
A CTH é o famoso transplante de médula óssea, onde se consiste em pegar célula tronco da medula de uma outra pessoa que são compatíveis com o paciente, é principalmente usado para tratar câncer de medula e leucemia
A CTA é um processo em que se pega medula óssea do próprio paciente e aplica em um local especifico, ela é muito utilizada para trata lesões, também pode ser usada para tratar doenças cardiovasculares.
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