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A diferença entre a epistase e a pleiotropia é a forma como os genes são expressos.
Interação gênica é o termo dado para o processo em que dois pares de alelos se separam de forma independente para depois se associarem e definirem a característica de um indivíduo.
Em uma interação gênica epistática, um gene não é expresso (hipostático) no fenótipo devido à ação de outro gene, o gene epistático. Já na pleiotropia existe um par de alelos que é capaz de influenciar diferentes caraterísticas do indivíduo.
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