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Assim como as bactérias, os fungos desempenham o papel de decompositores na natureza. Como já vimos, os decompositores são fundamentais na manutenção do equilíbrio natural dos ecossistemas: eles decompõem os cadáveres e os resíduos de seres vivos (como fezes e urina), absorvendo somente uma parte para a sua nutrição. Os fungos, assim como as bactérias, são os principais decompositores na natureza, apresentando um papel muito importante na reciclagem dos nutrientes orgânicos e, portanto, são fundamentais para que o equilíbrio seja instaurado na natureza.
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