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O problema sério da técnica é o envelhecimento precoce ou encolhimento dos telômeros (estruturas cromossômicas que se desgastam à medida que a célula se divide e envelhece). Assim um clone que acabou de nascer pode apresentar material genético já "desgastado". Também a maioria dos filhotes clonados nasce com até o dobro do peso normal, o que pode acarretar complicações respiratórias e cardiovasculares. Muitos nascem com deformidades, como vacas com cabeças e focinhos achatados, e não sobrevivem. Há riscos sérios também das fêmeas que recebem os embriões, que podem inchar ao ponto de estourar os músculos do abdómen. O cordão umbilical e a placenta costumam crescer de maneira anormal.
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