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O nucleotídeo livre se encontra em fitas de RNA, já os ligados aos seus respectivos pares estão nas fitas de DNA.
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Um nucleotídeo livre tem algumas funções, sendo um exemplo o transporte de energia, ou a sinalização intracelular. Pode estar na forma cíclica ou não.
Já o nucleotídeo que se liga a um par é a unidade de formação de ácidos nucleicos, sendo o principal dos que apresentam pares de nucleotídeos o DNA. Há também o dsRNA, que é o RNA de fita dupla. Esses nucleotídeos servem para o armazenamento e transmissão de informações genéticas.
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