Respostas
Em um elemento neutro, o número de elétrons é o mesmo que o número de prótons. Utiliza-se o próton porque ele compõe - juntamente com os nêutrons - a massa do átomo. Os elétrons estão em constante movimento nas orbitais do átomo, formado por prótons + nêutrons.
Bons estudos!
O fator primordial para essa explicação é que os prótons por estarem localizados no núcleo do átomo dificilmente conseguem "escapar", ou seja, é mais incomum perder prótons em condições naturais do que perder elétrons.
Assim, utilizando o número de prótons você tem um valor considerado mais estável, haja vista que naturalmente as cargas (cations e anions) se formam pela perde de elétrons, se você considerasse os elétrons para dizer o número atômico de um elemento ele iria variar constantemente, fato que não ocorre tão facilmente com os prótons.