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Lei é algo comprovado e experimentado, algo oficial. Exemplo: Lei de Boyle, lei de Newton.
Teoria é algo que tem fundamentos, pode até ter experimentos, mas é apenas parcialmente confirmado. Exemplo: teoria criacionista, teoria evolucionista.
Hipótese é apenas uma suposição, um possível elemento. Exemplo: A hipótese de Ernest Rutherford, de que haviam nêutrons no núcleo atômico (hipótese confirmada em 1932 por outro cientista).
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