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Os corantes são de extrema importância para a visualização de estruturas celulares. Seu uso faz com que certas estruturas fiquem evidenciadas ao microscópio. No caso do uso da hematoxilina, por exemplo, ela deixa o núcleo com uma cor meio roxa, pois esse corante é de caráter básico e reage com o núcleo que é ácido; outro exemplo é o uso da eosina, que é um corante de caráter ácido e reage com o citoplasma que é básico, corando-o com uma coloração meio rosada. Com esses corantes fica muito mais fácil identificar estruturas, por isso seu uso é importantíssimo.
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