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Em 1943 no governo de Getúlio Vargas o Amapá é separado do Pará e transformado em território nacional. Alguns anos depois em 1946 é oficialmente descoberta uma reserva de manganês em solo amapaense, próxima do que hoje conhecemos como a cidade de Serra do Navio.
O manganês é um minério utilizado na produção de aço, cuja necessidade da produção de armamentos em decorrência da guerra fria (1950) fez com que a demanda pelo minério aumentasse.
Em 1953 o governo autoriza a ICOMI (Indústria de comércio e mineração) a explorar manganês na serra do navio durante 50 anos. A ICOMI em parceria com a mineradora americana Bethlem steel começou a explorar o minério. Como a área onde o projeto seria instalado não possuía infraestrutura diversos investimentos foram feitos, dentre eles a estrada de ferro do amapá e as company towns Vila amazonas e Serra do Navio. Também podem ser atribuídos ao projeto ICOMI a criação do porto de Santana (para o escoamento do manganês do projeto) e até mesmo a construção da hidrelétrica Icoracy Nunes (no rio Araguari) que foi em parte financiada pela empresa.
O declínio do projeto.
Em 1970 a jazida (superficial) começou a apresentar os primeiros sinais de esgotamento, o manganês por ser de baixa qualidade precisava ser refinado para que fosse exportado. Os lucros do projeto tiveram uma gigantesca queda e em pouco tempo a Bethlem steel quebra a parceria com a ICOMI e abandona o projeto.
A ICOMI porém continua o projeto. O manganês sofre desvalorização na década de 80, a URSS acaba em 1991 e junto dela, a guerra fria.
Em 1998 a ICOMI finalmente encerra suas atividades.
A refinaria de manganês da ICOMI localizada na área portúaria de Santana liberou enormes quantidades de arsênio (substancia altamente cancerígena). Teorias apontam a grande quantidade de casos de câncer no Amapá como sendo decorrente do arsênio liberado durante o período de atividade do projeto. A ICOMI foi vendida para a empresa alto Tocantins em 2003 pelo valor simbólico de 1R$, para evitar processos em decorrência da contaminação por arsênio da região.