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As bactérias também são amplamente
utilizadas no combate as pragas na agricultura. Um exemplo disto é o
Bacillus thuringensi. Os micro-organismos aumentam
a fertilidade do solo pela conversão, do nitrogênio atmosférico em compostos nitrogenados, utilizados pelas plantas na
síntese de proteínas. Convertem as substâncias orgânicas em compostos inorgânicos, tornando-os úteis para os
vegetais. Aceita-se que os micro-organismos decompõem os vegetais e animais mortos, mas não é
possível imaginar, às vezes que as reações bioquímicas realizadas fertilizam o
solo pelo fornecimento de nutrientes. Este é um processo complexo, do qual participam muitos tipos de
microrganismos. Calcula-se que 0,4 há de solo fértil contém cerca de 500kg de
bactérias e talvez, quantidades equivalentes de fungos, protozoários e algas. É
uma verdade generalizada que, quanto mais micro-organismos existirem no solo,
mais produtivo ele será.
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