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A principal função dos microorganismos no solo, em especial dos fungos e das bactérias, é realizar uma das etapas mais importantes para a continuidade do ciclo da cadeia alimentar: realizar a decomposição das matérias orgânicas, promovendo a fertilização do solo, na medida em que a matéria decomposta é devolvida à terra de maneira mais simples.
Estes organismos são fundamentais para promover uma melhora na fertilidade do solo, o que promove maiores vantagens no plantio e, portanto, na colheita de gêneros alimentícios ou ornamentais. O uso de terra com microorganismos como estes é bastante recorrente, dado que eles auxiliam os produtores primários a alcançar seu nível de nutriente necessário.
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