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Os antibióticos são produzidos por bactérias, actinomicetos e fungos. Entre os fungos, somente os antibióticos produzidos por Aspergillaceae e Moniliales são de importância prática. Os compostos isolados a partir de basidiomicetos não têm uso prático. Entre as bactérias, existem muitos grupos taxonômicos que produzem antibióticos.
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