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Bem, na minha opinião, a diferença entre vírus e bactérias é que o vírus é formado por uma cápsula de proteína, já a bactéria é formado por uma única celula( unicelular).
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Os dois são invisíveis a olho nu, se multiplicam rapidamente em um curto período de tempo e podem causar doenças. Mas essas são as poucas características que bactérias e vírus têm em comum.