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Elas se distinguem na sua estrutura,resumindo as células procariontes são mais simples que as eucariontes.
Exemplo:
Procariontes:O DNA é geralmente circular, e não tem associação com proteínas das histonas.
Eucariontes:O DNA é comumente linear, está dentro do núcleo, e é associado às histonas.
Obs:Espero ter ajudado um pouco.
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