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Na indústria farmacêutica podemos citar o gênero fúngico Penicillium, amplamente utilizado na área médica devido à produção da penicilina. Outro exemplo de fármaco é a ciclosporina, isolada do fungo Tolypocladium inflatum , é uma droga imunossupressora, utilizada para reduzir a probabilidade de rejeição de um órgão transplantado.
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