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- Filo Bacillariophyta. Abriga as diatomáceas; encontradas predominantemente em ambiente marinho, mas também habitando lagos de água doce. Elas possuem clorofila a e c e carotenoides.
- Filo Chrysophyta. Abriga as algas douradas, também chamadas de crisofíceas; encontradas em água doce ou salgada.
- Filo Dinophyta. Abriga os dinoflagelados, encontrados em ambiente marinho e de água doce.
- Filo Euglenophyta. Abriga os euglenoides, típicos de água doce. Eles possuem clorofilas a e b, além de carotenoides; armazenam paramilo e a parede celular está ausente.
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