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Ciclo de Krebs
Embora a mitocôndria possua seu próprio DNA, suas funções são muito mais dependentes das proteínas codificadas pelo núcleo do citosol, ao quais são importantes do ciclo do ácido tricarboxílico ou ciclo de Krebs. Este ciclo representa o segundo estádio da respiração e ocorre na matriz mitocondrial. Para iniciar as reações, é necessária a entrada do piruvato que foi formado no citosol através das reações de glicólise, porém a membrana interna da mitocôndria é impermeável ao piruvato, dessa forma, existe um transportador de piruvato (monocarboxilado) que catalisa uma mudança elétrica através da membrana interna resultando em piruvato e OH-.
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