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As características dos cloroplastos e das mitocôndrias sugerem que essas organelas surgiram graças a uma associação simbiótica com outro organismo. A teoria que explica o surgimento dessas organelas é chamada de teoria endossimbiótica.
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Acredita-se que os cloroplastos tenham se originado de organismos procariontes fotossintéticos (algas azuis).
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