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Transmissão : Neste microscópio o feixe de elétrons atravessa a célula e forma a imagem em uma tela fluorescente, dando detalhes de moléculas, organelas e estruturas intracelulares, tendo capacidade de produzir imagens de alta resolução e ampliação (até 300 mil vezes).
Varredura: O Microscópio Eletrônico de Varredura examina a superfície do tecido, de modo que o feixe de elétrons não atravessa o espécime. Os elétrons secundários são captados por detectores, os quais criam um sinal elétrico, que é projetado em uma tela de televisão.
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