Question

por que escrevemos com letras diferentes palavras que são pronunciadas com os mesmos sons?

Answer 1

Em razão de seu significado, origem e formação, depreende-se de estudo etimológico. 
Por exemplo: tacha e taxa. Tem mesmo som, mesma pronúncia, mas possuem significados diversos e sua escrita também é diferente...
chamam-se palavras "Homófonas". . 

Espero ter ajudado