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O conceito inicial de ecossistema foi definido como um conjunto de elementos funcional básico, formado pelos componentes bióticos e abióticos, sendo considerado a unidade básica ao redor da qual se pode organizar, analisar e estudar a ecologia e seus mais variados aspectos.
Dessa forma, por se tratar do conjunto de fatores bióticos e abióticos de um determinado lugar, o ecossistema pode abranger desde imensas florestas (macrossistemas), como locais pequenos como alguns centímetros de serapilheira ou uma simples poça d'água (microssistema).
Portanto, independente do tamanho, é considerado ecossistema qualquer ambiente onde há a interação entre o meio físico e os seres vivos.
Uma característica fundamental de um ecossistema é a relação estável entre o espaço físico, o fluxo de energia e os fatores bióticos e abióticos. Com isso, nem todo sistema biológico pode ser chamado de ecossistema caso não seja autossuficiente e não possua autorregulação.
Um exemplo disso é um aquário fechado que, uma vez que é esquecido e não tenha uma ação antropogênica para ajustar as condições e características. Ele entra em colapso com o tempo.
Todos os componentes de um ecossistema podem ser agrupados em dois grandes grupos, formando os fatores: