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Podemos classificar pelo formato: bacilos (forma de bastonetes), cocos (circulares e subdivididos em diplococos, estreptococos e estafilococos), espirilos (em forma de espiral) e também pela existência de flagelos: lofotríquias (um tufo de flagelos somente), peritríquias (flagelo em todo o corpo), anfitríquias (um tufo de flagelos em cada lado), monotríquias (um flagelo).
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