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A principal diferença entre a teoria do big bang e da seleção natural cosmológica, é que a primeira afirma que o universo surgiu de uma grande explosão e liberação de energia, enquanto a última afirma que os universos surgem através de buracos negros e universos anteriores.
A teoria do big bang se apoia no fato de que o nosso universo está em expansão, e por isso, seus componentes já estiveram unidos no passado até explodirem e gerarem as estrelas e os planetas como conhecemos hoje. Entretanto, a seleção natural cosmológica se baseia no fato de que nosso universo possui características muito bem adaptadas para receber a vida, e que se fosse levemente diferente isso nunca seria possível.
Por isso, Lee Smolin, criador da teoria de seleção natural cosmológica, afirmou que os universos conseguem gerar outros universos que "herdam" certas características, levando à formação de universos com as condições ideias para abrigar a vida.