Question

embora e portanto estabelecem entre as ideias, respectivamente, relações de ?

Answer 1

Embora, conjunção concessiva, tem a mesma ideia de: mesmo que, se bem que, apesar de que; ela indica uma contrariedade.

Portanto é conjunção conclusiva, a mesma ideia que: por isso, dessa maneira, isso posto, assim sendo, por consequência. 

As duas então, estabelecem idéias de certa contrariedade e dúvida. 
Pois uma explica e conclui (portanto) e a outra é contrária, condiciona a uma duvida (embora).