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A protocooperação e o mutualismo são duas relações harmônicas e interespecíficas. Elas são tão parecidas que a protocooperação também é conhecida como mutualismo facultativo.
A única diferença entre elas é que a protocooperação é uma relação não obrigatória. Enquanto isso, o mutualismo possui caráter obrigatório, onde as duas espécies precisam uma da outra para a sobrevivência.
Quando o mutualismo é obrigatório, ele também pode ser chamado de simbiose.
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