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Para Dalton o átomo era uma massa indivisível, a menor unidade da matéria, e não possuía partículas subatômicas. Por experimentações com o Tubo de Crookes, Thomson descobriu que todo átomo possuía uma partícula eletricamente negativa, o elétron, com o mesmo Tubo de Crookes,Goldstein descobriu o próton. Logo, o átomo possuía partículas subatômicas. Thomson propôs que o átomo era esfera carrega positivamente com elétrons incrustados na sua superfície. Após os estudos de Rutherford, bombardeando uma lamina de ouro com partículas alfas, descobriu que o núcleo é muito pequeno, e o átomo era predominantemente vazio, e os elétrons circulavam em volta do núcleo. Depois Bohr aperfeiçoou esse modelo, quantizando a energia. E o modelo aceito, é muito próximo do modelo Rutherford-Bohr, a diferença é que os orbitais não são circulares e nem definidos, é uma região de alta densidade eletrônica aproximadamente esférica.
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