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As euglenófitas apresentam como característica principal a presença de flagelos. Elas possuem dois flagelos, um mais longo que o outro. O flagelo menor não emerge para fora da célula. Já o maior é usado principalmente para locomoção.
As diatomáceas são unicelulares ou coloniais; os flagelos são ausentes, mas podem aparecer em gametas; a substância de reserva energética é um polissacarídeo solúvel em água, a crisolaminarina e outro tipo são os lipídios, estocados em vacúolos
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