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De acordo com o tipo de locomoção e de reprodução, os protozoários podem ser classificados em: Rizópodes, Flagelados, Ciliados e Esporozoários.
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Umas das caracteristicas, é a locomoção desses seres no meio aquático. De acordo com esse sistema existem protozoários ciliados, flagelados rizópodos, e esporozoários.
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