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Alguns fungos não são patogênicos em pessoas humanas saudáveis, mas podem ser virulentos para indivíduos que sofrem de alguma doença como por exemplo: linfomas malignos, diabetes severa, AIDS ou para indivíduos que vêm sendo tratados com drogas antibacterianas ou com imunossupressores .
As espécies mais comuns de fungos oportunistas, pertencem aos gêneros: Candida, Aspergillus, Rhizopus, e Mucor.
Em alguns experimentos, podemos observar claramente a baixa de resistência de camundongos. Por exemplo: camundongos tratados com cortisona, são usualmente susceptíveis à infecção letal com Candida albicans.
Além desses, entre os fungos patogênicos que serão discutidos posteriormente, como: Cryptococcus neoformans, Histoplasma capsulatum, Blastomyces dermatitidis, e possivelmente, mesmo Coccidioides immitis, também podem ser considerados oportunistas, causando infecções progressivas mais frequentemente sob condições debilitantes do indivíduo.
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