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Os antibióticos, quando utilizados de forma indiscriminada, podem fazer com que alguns microorganismos adquiram resistência aos mesmos, dificultando o tratamento de algumas doenças. Além disso, o uso de antibióticos pode fazer com que haja um desequilíbrio na microbiota fazendo com que haja um aumento da população das espécies que antes concorriam com as bactérias, como alguns tipos de fungos, levando ao aparecimento de outras infecções.
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