Question

Oq acontece com as moleculas de uma substância quando esta aquecida

Answer 1

Sim o calor faz com que as moléculas se agitem e ocorra colisões com maior velocidade. 
No caso depende de qual material vc esta trabalhando. Se for agua por exemplo: o processo fica conhecido como evaporação. Se for um metal sendo aquecido: o processo fica conhecido como to ou fundição.(derretimento)

Answer 2

Quantidade de calor está diretamente ligada a alguns fatores, mas olhando em nível molecular podemos admitir que calor está relacionado diretamente a excitação da molécula ou se preferir o quanto ela se movimenta, portanto com maior calor temos maior movimento.
Bons estudos e tchau :)