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O organismo reconhece o órgão transplantado como um corpo estranho, fazendo com que o sistema imunitário/imunológico entre em ação, atacando-o. Por isso, pessoas que passaram pelo transplante de órgãos devem tomar remédios para diminuirem a atividade imunológica, abaixando sua resistência, ficando mais propensos a doenças.
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