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Além de serem importantes como decompositores, na indústria alimentícia e de bebidas, os fungos também são muito importantes na indústria farmacêutica, na produção de antibióticos como a penicilina, que é amplamente empregada nos dias atuais.
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A partir destas substâncias são fabricados antibióticos, como a penicilina, utilizada no combate a doenças infecciosas causadas por bactérias do gênero Streptococcus. Muitos fungos são parasitas, causando doenças nos animais, no homem, e também nas plantas.
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