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Muitas espécies de fungo ajudam com a decomposição de matéria orgânica, como folhas e animais mortos;
Há também relações simbióticas, como micorrizas, onde os fungos disponibilizam fósforo, zinco, manganês e cobre, ajudando no desenvolvimento das plantas
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Fungos fazem decomposição de matéria orgânica, disponibilizando nutrientes ao solo, deixando-o mais fértil. Além disso os fungos podem fazer uma espécie de mutualismo, chamado de líquen, este que é uma espécie de sociedade entre fungos e cianobactérias ou fungos e algas, esta sociedade beneficia as duas espécies envolvidas.
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