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As arqueas possuem uma característica muito marcante, que diz respeito ao seu habitat: vivem em ambientes extremos, quase que incompatíveis com a presença de seres vivos; como em gêiseres e vulcões (termófilas extremas); lagos ácidos e altas concentrações salinas (halófitas extremas); pântanos, ou tubo digestório de determinados animais, produzindo metano (metanogênicas). Acredita-se que este fato se deve à antiguidade do grupo, e às poucas mudanças que seus representantes sofreram ao longo do tempo, já que na Terra primitiva tais condições eram encontradas.
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