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O processo de respiração anaeróbica é típico dos procariontes. Esse grupo de organismos é caracterizado pela falta de um núcleo verdadeiro (delimitado por uma membrana biológica) e de compartimentos subcelulares, como mitocôndrias ou cloroplastos. Dentro deste grupo estão bactérias e arquéias.
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Organismos como fungos e bactérias, por exemplo, realizam a respiração na falta do oxigênio.
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