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Elas auxiliam: digestão de ruminantes, tratamento de esgoto, produção de antibióticos, fabricação de laticínios etc. As bactérias não são somente organismos causadores de doenças! Elas contribuem, e muito, para melhorar a qualidade ambiental e de vida de diversas espécies.
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No corpo humano as bactérias não patogênicas são responsáveis por diversas coisas, tais como, produção de vitamina K (um coagulante que nosso corpo não produz), digestão de celulose, manter afastadas as bactérias patogênicas (daí a importância de não utilizar antibióticos sem uma real necessidade, eles selecionam as patogênicas resistentes aos antibióticos e os mesmos antibióticos matam as "boas bactérias".
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