A coloração consiste numa etapa muito importante para a visualização das estruturas do tecido. Normalmente são utilizados corantes hidrossolúveis, sendo necessário, deste modo, a remoção da parafina da peça que foi preparada nas etapas descritas anteriormente e que permanece na lâmina de vidro. Existem muitos tipos de corantes, dentre os existentes podemos citar os:.
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Corantes que diferenciam os componentes ácidos e básicos das células
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