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O microscópio foi inventado 1590 por Hans Janssen e pelo filho do mesmo, Zacharias, que eram dois holandeses fabricantes de óculos. Mas, no entanto, acredita-se que as primeiras observações de material biológico foram feitas por Antonie van Leeuwenhoek. O microscópio foi também melhorado por Isaac Newton, que descobriu a Lei da Gravidade.
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